小鲨鱼2018 博客园 首页 新随笔 联系 订阅 管理 2026年9月21日 Linux 中根据SRA号获取样本的详细信息 摘要： 001、命令 epost -db sra -input a.txt -format acc | esummary -format runinfo > runinfo.csv 002、input format (base) [b20223040323@admin2 014_talbe]$ cat a. 阅读全文 posted @ 2026-09-21 10:19 小鲨鱼2018 阅读(7) 评论(0) 推荐(0) Linux 中如何将文本的首个字母转换为大小 摘要： 001、 [root@localhost data01]# ls a.txt [root@localhost data01]# cat a.txt female male female female female [root@localhost data01]# sed "s/^\([a-z]\)/ 阅读全文 posted @ 2026-09-21 10:12 小鲨鱼2018 阅读(6) 评论(0) 推荐(0) Linux 中 抽取特定字符+数字的字段 摘要： 001、 [root@localhost data01]# cat a.txt ## 测试数据， 抽取每行的SRS号码 SRR12959515,2024-10-23 00:10:08,2020-11-01 05:28:44,115588444,34676533200,115588444,300,10 阅读全文 posted @ 2026-09-21 09:38 小鲨鱼2018 阅读(7) 评论(0) 推荐(0) 2026年9月6日 linux 中awk语句输出每一列类别最小值或者最高值 摘要： 001、 按照第一列的类别及最后一列值输出最小值 (base) [b20223040323@admin2 test1]$ ls a.txt (base) [b20223040323@admin2 test1]$ cat a.txt 2 2_run1.log:CV error (K=2): 0.422 阅读全文 posted @ 2026-09-06 12:05 小鲨鱼2018 阅读(13) 评论(0) 推荐(0) 2026年8月27日 Linux中按照指定列去重复 摘要： 001、 [root@localhost test2]# ls a.txt [root@localhost test2]# cat a.txt ## 测试数据 a 7 a 10 a 9 a 2 b 5 b 12 c 4 c 6 c 3 c 11 d 8 d 1 [root@localhost tes 阅读全文 posted @ 2026-08-27 19:51 小鲨鱼2018 阅读(13) 评论(0) 推荐(0) Linux 中按照指定列中的项取平均值 摘要： 001、 [root@localhost test2]# ls a.txt [root@localhost test2]# cat a.txt ## 测试数据 a 7 a 10 a 9 a 2 b 5 b 12 c 4 c 6 c 3 c 11 d 8 d 1 [root@localhost tes 阅读全文 posted @ 2026-08-27 19:47 小鲨鱼2018 阅读(9) 评论(0) 推荐(0) bcftools给vcf文件添加染色体长度 摘要： 001、 (smcpp_env) [b20223040323@admin2 x_test]$ ls Africa.recode.vcf.gz Africa.recode.vcf.gz.tbi chr.list GCF_016772045.2_ARS-UI_Ramb_v3.0_genomic.fna. 阅读全文 posted @ 2026-08-27 15:47 小鲨鱼2018 阅读(9) 评论(0) 推荐(0) 2026年8月6日 不完全谱系排序 摘要： 001、 不完全谱系排序 a、 b、 。 造成不完全谱系排序的关键点在于：物种快速分化（大猩猩分化出来和人类-黑猩猩公共祖先继续分化之间时间太短，没有经过遗传漂变固定导致人类-黑猩猩共同祖先还处于多态状态就开始继续分化，造成进化基因随机固定）。 ILS: 在多个物种形成之前，它们的共同祖先群体中已经 阅读全文 posted @ 2026-08-06 17:33 小鲨鱼2018 阅读(7) 评论(0) 推荐(0) 2026年8月3日 fortran 中 矩阵乘法 摘要： 001、 [root@rocky01 fortran]# ls test01.f90 [root@rocky01 fortran]# cat test01.f90 ## 测试程序 program test01_fortran implicit none integer :: ay1(2,2) int 阅读全文 posted @ 2026-08-03 17:06 小鲨鱼2018 阅读(10) 评论(0) 推荐(0) 2026年8月1日 linux 中 sed命令单引号文本 前添加转义字符 摘要： 001、 [root@rocky01 test02]# ls a.txt [root@rocky01 test02]# cat a.txt 01 02 03 04 05 06 ab'07 08 09 10 11 12 13 ab'14 15 16 17 18 19 20 [root@rocky01 阅读全文 posted @ 2026-08-01 22:06 小鲨鱼2018 阅读(11) 评论(0) 推荐(0) 下一页 公告 博客园 © 2004-2026 浙公网安备 33010602011771号 浙ICP备2021040463号-3